Here is a list of all documented class members with links to the class documentation for each member:

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• ifclose() : InputFile
• ifeof() : InputFile
• ifgetc() : InputFile
• ifileCompression : InputFile
• ifread() : InputFile
• ifrewind() : InputFile
• ifseek() : InputFile
• iftell() : InputFile
• ifwrite() : InputFile
• IncrementCount() : CigarRoller
• INDEX_NA : Cigar
• InputFile() : InputFile
• insert : Cigar
• int2base : BaseAsciiMap
• int2colorSpace : BaseAsciiMap
• INVALID : GlfStatus
• isActiveHeaderRecord() : SamHeaderRecord
• isAmbiguous() : BaseUtilities
• isCharType() : SamRecord
• isClip() : Cigar
• isColorSpace() : GenomeSequence
• isContinuableStatus() : GlfStatus
• isDoubleType() : SamRecord
• IsEOF() : SamFile
• isEOF() : GlfFile
• isIntegerType() : SamRecord
• isMatchOrMismatch() : Cigar
• isMDTagCorrect() : SamTags
• isOpen() : InputFile
• IsOpen() : SamFile
• isStringType() : SamRecord
• isValid() : SamRecord , SamHeaderRecord
• isValidCigar() : SamValidator
• isValidSequence() : SamValidator